Особенно это актуально для программ которых в репозиториях отродясь не было. Тот же Lekhonee появился в репах karmic’а позднее, а в jaunty и не появится, видимо. Можно, конечно, использвать сторонние репозитории, однако иногда уже есть пакет исходников, и быстрее поставить его.